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Artigo de pesquisadores do CeMEAI se destaca no cenário acadêmico

Trabalho também resultou em software de simulações de dinâmica molecular

 

No início de 2003, os pesquisadores José Mario Martínez, do Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC) da Unicamp, e Leandro Martínez, do Instituto de Química também da Unicamp, publicaram um artigo a respeito de geração automática de configurações iniciais para simulações dinâmicas de moléculas.

O trabalho foi o início de uma série de estudos que se desenvolveu e, em 2009, culminou em um segundo artigo sobre o tema e que contava também com a participação de Ernesto Birgin, do Instituto de Matemática e Estatística (IME) da USP. A segunda publicação já trazia uma novidade importante: era o software Packmol, que criou novas perspectivas para a área das simulações de dinâmica molecular.

A importância do Packmol tem sido refletida pelos números de citações em artigos científicos. Os autores, que são membros de Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) da FAPESP – José Mario e Ernesto do Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI) e Leandro do Centro de Pesquisa em Engenharia e Ciências Computacionais (CCES) – têm comemorado o alcance internacional do artigo.

Em dezembro de 2015, a publicação tinha cerca de 500 citações na plataforma Web of Science. Atualmente, já são por volta de 1500. Esse número faz com que o artigo seja o 3º mais citado na Web of Science entre os financiados pela Fapesp, o 3º da Unicamp em todos os tempos, o 4º entre os da CAPES e o 9º do CNPq.

Outro exemplo da popularização do artigo vem em forma de vídeos. Curiosamente, já são até encontrados tutoriais do Packmol em persa e tailandês. O software continua sendo atualizado com apoio do CeMEAI e, até o mês de novembro deste ano, já foi baixado mais de 23 mil vezes. Conheça melhor o software:

 

Um programa desenvolvido por pesquisadores do CEPID - CeMEAI e do eScience trouxe novidades na área de simulações de dinâmica molecular. Entenda como o Packmol funciona: http://goo.gl/ItVxL0

Publicado por CEPID - CeMEAI em Quarta-feira, 9 de dezembro de 2015

 

Sobre o CeMEAI

O Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI), com sede no Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC) da USP, em São Carlos, é um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) financiados pela FAPESP.

O CeMEAI é estruturado para promover o uso de ciências matemáticas como um recurso industrial em quatro áreas básicas: Otimização Aplicada e Pesquisa Operacional, Mecânica de Fluidos Computacional, Modelagem de Risco, Inteligência Computacional e Engenharia de Software.

Além do ICMC-USP, CCET-UFSCar, IMECC-UNICAMP, IBILCE-UNESP, FCT-UNESP, IAE e IME-USP compõem o CeMEAI como instituições associadas.

 

Leonardo Zacarin - Assessoria CEPID-CeMEAI

 

Mais informações

Assessoria de Comunicação do CeMEAI: (16) 3373-6609 

E-mail: Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.

Íntegra - A Terceira Margem: Psicologia por Engano

 

Na última semana, o ciclo de palestras "A Terceira Margem", do IMECC/Unicamp, foi apresentado pelo vice-diretor do CeMEAI. Confira a íntegra da apresentação de José Mario Martínez:

 

Íntegra - A Terceira Margem: Psicologia por Engano

Na última semana, o ciclo de palestras "A Terceira Margem", do Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica da UNICAMP, foi apresentado pelo vice-diretor do CEPID - CeMEAI. Confira a íntegra da apresentação de José Mario Martínez:

Publicado por CEPID - CeMEAI em Quarta-feira, 3 de outubro de 2018

Ciclo de palestras no IMECC fala sobre psicologia e matemática

Edição de "A Terceira Margem" foi apresentada por vice-diretor do CeMEAI

 

Na última quinta-feira, o Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC) da Unicamp promoveu mais uma edição do ciclo de palestras "A Terceira Margem".

O apresentador da vez foi o professor José Mario Martínez, do próprio IMECC e vice-diretor do Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI). Martínez falou sobre uma experiência incomum que teve na juventude. Com o título "Psicologia por Engano", a apresentação relatou os efeitos dessa experiência na formação intelectual do pesquisador.

Veja como foi o evento:

 

Ciclo de palestras no IMECC fala sobre psicologia e matemática

Na tarde de ontem, o Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica da UNICAMP realizou mais uma edição do ciclo de palestras "A Terceira Margem". O apresentador da vez foi José Mario Martínez, vice-diretor do CEPID - CeMEAI. Veja como foi:

Publicado por CEPID - CeMEAI em Sexta, 28 de setembro de 2018

4ª Conferência sobre Métodos de Otimização e Software ocorrerá em Havana

Prazo para submissão dos resumos vai até 15 de setembro

 

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A 4ª Conferência sobre Métodos e Software de Otimização ocorrerá entre 16 a 20 de dezembro deste ano em Havana, Cuba. O evento é também organizado em comemoração ao 25º aniversário da revista. Tem como objetivo rever e discutir avanços recentes e tendências de pesquisa em teoria de otimização, métodos, aplicações e desenvolvimento de software.

O prazo para as submissões dos resumos vai até 15 de setembro de 2017. As notificações de aceitação saem até o dia 30 do mesmo mês.

O presidente do Comitê Organizador na América do Sul é o pesquisador do CEPID-CeMEAI José Mario Martínez.

Para saber mais sobre o evento, tópicos e organização das conferências acesse a página do evento.

 

Sobre o CeMEAI

O Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI), com sede no Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC) da USP, em São Carlos, é um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) financiados pela FAPESP.

O CeMEAI é estruturado para promover o uso de ciências matemáticas como um recurso industrial em quatro áreas básicas: Otimização Aplicada e Pesquisa Operacional, Mecânica de Fluidos Computacional, Modelagem de Risco, Inteligência Computacional e Engenharia de Software.

Além do ICMC-USP, CCET-UFSCar, IMECC-UNICAMP, IBILCE-UNESP, FCT-UNESP, IAE e IME-USP compõem o CeMEAI como instituições associadas.

 

Raquel Vieira - Comunicação CeMEAI

 

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Assessoria de Comunicação do CeMEAI: (16) 3373-6609

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CeMEAI é destaque em revista internacional

Publicação é da Sociedade Americana de Matemática

 

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A edição de número 64 da Notices of the American Mathematical Society, uma das revistas voltadas a matemáticos mais lidas no mundo, traz um artigo que apresenta o Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CEPID-CeMEAI) aos mais de 30 mil pesquisadores que recebem a publicação mensalmente.

O artigo que destaca o CEPID-CeMEAI é de autoria de José Alberto Cuminato, diretor da entidade, e dos pesquisadores Ernesto Birgin, José Mario Martínez e Tiago Pereira, associados ao centro. “Certamente, é uma divulgação muito importante, porque essa revista é distribuída no mundo inteiror e seus leitores são especialistas da área de matemática. Essa divulgação do CeMEAI irá tornar o grupo e suas atividades mais conhecidos, o que, em geral, reforça nosso prestígio junto à comunidade e contribui para que novos projetos e colaborações se viabilizem”, comemora Cuminato.

Além de apresentarem o Centro, os pesquisadores também citam alguns trabalhos desenvolvidos: o Packmol, programa de computador que cria configurações iniciais para simulações de dinâmica molecular, o software PUMA e a sincronização de sistemas complexos. Confira o artigo na íntegra:

 

Sobre o CeMEAI

O Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI), com sede no Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC) da USP, em São Carlos, é um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) financiados pela FAPESP.

O CeMEAI é estruturado para promover o uso de ciências matemáticas como um recurso industrial em quatro áreas básicas: Otimização Aplicada e Pesquisa Operacional, Mecânica de Fluidos Computacional, Modelagem de Risco, Inteligência Computacional e Engenharia de Software.

Além do ICMC-USP, CCET-UFSCar, IMECC-UNICAMP, IBILCE-UNESP, FCT-UNESP, IAE e IME-USP compõem o CeMEAI como instituições associadas.

 

Leonardo Zacarin - Comunicação CeMEAI

 

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Poesia de cordel demonstra teoria de Georg Cantor e outros matemáticos

Esta foi a tônica do Seminário de Coisas Legais apresentado por José Mario Martínez

 

O vice-diretor do Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI) e professor do Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC) da UNICAMP, José Mario Martínez, encerrou o ciclo de apresentações do Seminário de Coisas Legais de 2016 falando, nesta sexta-feira (18), sobre poesia de cordel e matemática.

Originalidade para demonstrar um texto escrito por ele e passando por hipóteses e teorias de matemáticos como Georg Cantor, Hilbert e Gödel.

Veja como foi assistindo ao vídeo da apresentação:

 

O Seminário de Coisas Legais de hoje foi apresentado por José Mario Martínez, vice-diretor do CEPID - CeMEAI. Veja como foi a palestra:

Publicado por CEPID - CeMEAI em Sexta, 18 de novembro de 2016

 

Sobre o CeMEAI

O Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI), com sede no Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC) da USP, em São Carlos, é um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) financiados pela FAPESP.

O CeMEAI é estruturado para promover o uso de ciências matemáticas como um recurso industrial em quatro áreas básicas: Otimização Aplicada e Pesquisa Operacional, Mecânica de Fluidos Computacional, Modelagem de Risco, Inteligência Computacional e Engenharia de Software.

Além do ICMC-USP, CCET-UFSCar, IMECC-UNICAMP, IBILCE-UNESP, FCT-UNESP, IAE e IME-USP compõem o CeMEAI como instituições associadas.

 

Raquel Vieira - Comunicação CeMEAI

 

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Pesquisador do CeMEAI apresenta Seminário de Coisas Legais

Evento será realizado nesta sexta-feira (18)

 

martinez

 

O professor José Mario Martínez, do Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC) da UNICAMP, será o apresentador da próxima edição do Seminário de Coisas Legais.

Martínez, que também é vice-diretor do Centro de Ciências Matemáticas Aplicadas à Indústria (CeMEAI), explicará as regras de composição das décimas espinelas, uma das formas (não a mais usual) usada no Cordel tradicional. O professor dará um exemplo com seu Cordel para Jorge Cantor, no qual mostra o surgimento teológico dos números ordinais, a hipótese do contínuo, o programa de Hilbert e o Teorema de Godel.

O Seminário será realizado na próxima sexta-feira (18) no auditório Fernão Stella de Rodrigues Germano, no bloco 6 do Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da USP em São Carlos. A apresentação começará pontualmente às 13h13, é aberta ao público e não é necessária inscrição prévia.

jornal unicamp

Um modelo matemático desenvolvido na Unicamp pode ajudar os produtores da avicultura de corte do país no melhor controle das condições climáticas às quais as aves são expostas dentro de um aviário. Desenvolvido pela matemática Denise Trevisoli Detsch, o modelo prevê, em tempo real, a temperatura interna do aviário, evitando o chamado estresse térmico do animal. Os ganhos são o bem-estar animal, aumento de produtividade, economia de energia e menor desgaste de equipamentos.

 

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Simulação de Dinâmica Molecular (Packmol)

Simulação de Dinâmica Molecular (Packmol)

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Pesquisadores

Ernesto Birgin, José Mario Martinez Perez, Leandro Martinez.

PACKMOL is a free software for building initial configurations for Molecular Dynamics. This software combines optimization tools with physical-chemical insight and is the result of a partnership of the AOG with Prof. Leandro Martínez, from the Institute of Chemistry - Unicamp, who is in charge of its maintenance. The main paper that describes Packmol has 355 citations in Webofscience (Core Collection). Packmol has been downloaded 11547 times from 6932 different users.

Packmol creates an initial point for molecular dynamics simulations by packing molecules in defined regions of space. The packing guarantees that short range repulsive interactions do not disrupt the simulations.

The great variety of types of spatial constraints that can be attributed to the molecules, or atoms within the molecules, makes it easy to create ordered systems, such as lamellar, spherical or tubular lipid layers.

The user must provide only the coordinates of one molecule of each type, the number of molecules of each type and the spatial constraints that each type of molecule must satisfy.

The package is compatible with input files of PDB, TINKER, XYZ and MOLDY formats.

http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/

Otimização em Granjas

Otimização em Granjas

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Pesquisadores

José Mario Martínez Perez, Dante Conti

We consider the production of broiler chicken into chicken houses, where the objective is to control parameters that influence the animal environment, the comfort of the birds and the rapid synthesis of protein for human consumption.

The birds are bred for slaughter in places called broiler houses, with varying degrees of technology, where power, temperature, humidity, sound intensity, biological vectors and lighting should be carefully monitored and controlled to optimize the variables of interest. Further, both control and state variables should be subject to external measurements by appropriate sensors, working in consistent intervals of time and optimally located.

The control model aims an online recording of all relevant variables, an online setting of the parameters according to the response evidenced by the sensors, and making decisions regarding the operation of the controls. Taking into account that the number of variables of interest are not small, the model is naturally divided into sub-models.

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